Bảo tàng Jacquemart-André bắt nguồn từ một bộ sưu tập cá nhân của một cặp vợ chồng: Edouard André và Nélie Jacquemart. Edouard André là một chính trị gia, xuất thân trong một gia đình theo đạo Tin Lành kinh doanh ngành ngân hàng. Vợ Edouard André, Nélie Jacquemart là một nữ họa sĩ. Cùng say mê nghệ thuật, hai người tới Ý hàng năm để tìm mua các tác phẩm cho bộ sưu tập của mình[1].

Năm 1869, Edouard André cho xây dựng một dinh thự trên đại lộ Haussmann vừa mới được mở. Công trình được giao cho Henri Parent, một kiến trúc sư theo trường phái truyền thống. Tới năm 1875, dinh thự của Edouard André hoàn thành.

Sau khi Edouard André mất vào năm 1894, Nélie Jacquemart tiếp tục sưu tầm các tác phẩm cho bộ sưu tập. Khi qua đời năm 1912, Nélie Jacquemart di tặng cho Institut de France dinh thự cùng bộ sưu tập để mở một bảo tàng. Tới năm 1913, bảo tàng mang tên hai người, Jacquemart-André được mở cửa[2].

Từ năm 1995, bảo tàng do công ty Culturespaces quản lý.